Perciò, tranne in casi particolari, una forte stimolazione ovarica è parte essenziale di una FIVET, anche se la quantità e il tipo di stimolazione può variare anche molto da caso a caso: si può andare da 75 a 900 UI di farmaco al giorno, a seconda delle caratteristiche della paziente. Ad esempio si userà una dose maggiore se la donna ha l'FSH alto e dunque ci si aspetta che le sue ovaie reagiscano poco alla stimolazione, mentre si userà una dose più bassa se la donna ha le ovaie policistiche (che tipicamente reagiscono molto alla stimolazione). Inoltre anche la stessa donna può reagire diversamente alla stimolazione da ciclo a ciclo, dunque non è raro che la stimolazione venga aggiustata in base a quel che succede di giorno in giorno.

La stimolazione si fa quasi sempre con gonadotropine.Si possono usare farmaci a base solo di FSH o anche farmaci che contengono LH.

Esistono dunque molti protocolli possibili a seconda del tipo di farmaco, della dose e dell'eventuale aumento o diminuzione della dose (a volte si parte con una dose più bassa che viene poi aumentata, a volte si parte con una dose più alta per poi diminuirla verso la fine della stimolazione).